TP 2 BIOMOLECULAS. ESTRUCTURA Y FUNCION DE LAS PROTEINAS
1) Explique las modificaciones postraduccionales que pueden producirse en las proteínas. Cuál es su importancia biológica?
2) Ud. desea aislar y purificar una proteína presente en una muestra biológica. Cuál de las siguientes metodologías emplearía? Justificar
a) centrifugación por zonas de velocidad
b) cristalografía de
rayos X
3) Describa el fundamento de la técnica de electroforesis rn gel de poliacrilamida con SDS
TP 3 ESTRUCUTURA Y FUNCION DE LOS ACIDOS NUCLEICOS
1) Para que se agrega etanol en la técnica de ADN procarionte?
2) Cuáles son las etapas de síntesis de un polipéptido? Explicar elongación
3) Hacer un diagrama de flujo [un cuadro conceptual] de la técnica para extracción de ADN procarionte.
1. Explique detalladamente el ciclo del virus de la rabia (algo asi, es un dibujito casi a lo último)
2. Qué se utiliza para romper la envoltura nuclear y la membrana en el protocolo con ADN procarionte?
3. Que función cumple el acetato de sodio?
1) Qué es un sistema regulador de 2 componente?. Explicar como se regula la síntesis de glutamina en los procariontes
2) Se puede realizar la extracción de ADN sin lizosimas?
3) Para que sirve la sacarosa en el buffer inicial (o algo asi)
1) Cuáles son las etapas para la síntesis de un polipéptido? explicar elongacion
2) como se evita q funcionen las endonucleasas?
3) Para q se utiliza tritón?
TP 4 FRACCIONAMIENTO CELULAR
1) V o F. Justificar.
a) la homogeneización es un proceso donde se rompe todas las membranas celulares, tanto la membrana plasmática como la de las organelas.
b) los peroxisomas se aíslan de la fracción microsomal.
c) Luego de desechar todas las organelas en la centrifugación diferencial lo q queda es el citosol, con enzimas solubles y filamentos del citoesqueleto.
2)a) qué órganos subcelulares componen la fracción microsomal?
b) qué reacción enzimática utiliza para caracterizarla? Explique
c) que otro método podría utilizar para caracterizar funcionalmente la fracción microsomal?
3) Cómo se diferencian las proteínas d membrana según su interacción con la membrana. Explique las características de cada una
TP 5 MANIPULACION DE CELULAS EN CULTIVO
1) que diferencia hay entre un hemidesmosoma y una adhesión focal?
2)
a) Q es un cultivo en confluencia?
b) Como hace para calcular el porcentaje de células viables?
3)
a) Como se almacenan y mantienen las células de una línea celular?
b) q se hace para q no se produzca la ruptura de las células por cristalización?
1- Indicar si las siguientes afirmaciones son verdaderas o falsas. Justificar.
a- Las uniones comunicantes están reguladas por la concentración de calcio y el pH intracelular.
b- Las uniones estrechas están constituidas por asociaciones de filamentos intermedios.
c- Los conexones constituyen las uniones de hendidura.
2- Realice un diagrama de flujo respecto de la etapa de cosecha de células que se llevara a cabo en el trabajo práctico.
3- ¿Como se almacenan y mantienen las células de una línea celular? ¿Y que se hace para q no se produzca la ruptura de las células por cristalización?
1) V o F
a) El transporte unidireccional en el tejido epitelial seria imposible si las proteínas de membrana del sector apical fueran las mismas q las del sector basolateral
b) las uniones comunicantes unen el citoesqueleto de células vecinas y a la matriz extra celular
c)(no me la acuerdo bien esta xD) las uniones adherentes y los desmosomas están formados x lectinas(o algo asi)
2) q línea celular se utiliza durante el tp? con que se suplementa?
3) como se realiza el recuento y se mide la viabilidad de las células cosechadas (o algo así tmb)
1. Contestar verdadero o falso y justificar.
a. la permebilidad de las uniones estrechas depende de la concentración de calcio y pH intracelulares
b. los hemidesmosomas están compuestos por fibras de filamentos intermedios estrechamente unidos
c. los conexones comunican el citosol de las células
2.Explicar el protocolo para la cosecha de células
3.a. ¿Como se almacenan y mantienen las celulas de una linea celular?
b. ¿Cómo se procede para evitar la ruptura de las celulas por cristalizacion?
1) Qué función tiene las uniones estrechas u oclusivas? Indique que proteínas se hallan en este tipo de unión.
2) Enumere los pasos a seguir para realizar un subcultivo. Qué función cumple la tripsina?
3) Cómo se almacenan y mantienen células viables para ser cultivadas? Cómo evita la formación de cristales que puedan romper las células?
TP 6 BIOMEMBRANAS: ESTRUCTURA Y TRANSPORTE
1) ¿Cuál/es de las siguientes propiedades es característica de las bombas ATPasa clase F? Justificar.
a.) localización en vacuolas
b.) Localización en cloroplastos y mitocondrias
c.) unión de ATP sobre el lado exoplasmático de la membrana
d.) Está constituida por una proteína integral con 12 pasos transmembrana
2) En la experiencia de permeabilidad de glóbulos rojos. ¿Qué fenómeno esta implicado? Defínalo.
3) Con respecto a la diálisis, responda verdadero o falso y justifique: "Si la concentración de proteínas de la membrana es suficientemente alta, éstas pueden vencer la energía que limita su difusión y atravesar la membrana."
1)V o F: sobre un canal iónico
a) tiene la misma velocidad que los transportadores
b) están abierto todo el tiempo
c) no me acuerdo xd
d) permite el paso de cationes como de aniones
2)En la experiencia de permeabilidad de glóbulos rojos. ¿Qué fenómeno esta implicado? Defínalo.
3) Con respecto a la diálisis, responda verdadero o falso y justifique: "Si la concentración de proteínas de la membrana es suficientemente alta, éstas pueden vencer la energía que limita su difusión y atravesar la membrana."
1. Elija la o las respuesta(s) correctas. La difusión facilitada se diferencia de la difusión simple en:
a. (no me acuerdo)
b. Algo del gradiente y la velocidad
c. Algo de la especificidad
d. Algo del delta G
2. Responda V o F
Algo asi como que lo que se va a hacer con los eritrocitos modificaba la permeabilidad de la membrana
3. Describa lo que se va a ver en la solución externa en la interna y que reactivos se utilizaran
1) Cuál de los siguientes factores incrementan la velocidad de difusión simple (pasiva) de un soluto a través de una bicapa fosfolipídica?
- incremento de la capacidad del soluto de disolverse en la membrana
- incremento de a hidrofilicidad del soluto
- incremento del espesor de la membrana
- incremento de las proteínas de transporte de la membrana
2) Nombre y defina el fenómeno que observará en la experiencia con los glóbulos rojos
3) Explique en una frase cual es el fundamento de la permeabilidad selectiva en la diálisis
TP 7 TECNICAS DE GENETICA MOLECULAR Y GENOMICA I
1) Explique el método de terminación de cadena o método didesoxi que permite secuenciar fragmentos de ADN. Qué longitud (en número de NTD) debería secuenciar si quisiera conocer la secuencia para la síntesis de una sonda?
2) Cómo se obtienen bacterias de E. Coli en la etapa de crecimiento exponencial?
1) Fundamentos de la amplificación por PCR
2) Por qué es necesaria la ampicilina en un medio de cultivo
TP 8 TECNICAS DE GENETICA MOLECULAR Y GENOMICA II
1) indique cual/es de los siguientes enunciados son FALSOS. Justifique
a) los ratones KO permiten estudiar el efecto de la inactivación de genes en animales, aún de genes esenciales
b) la obtención de ratones transgénicos implica la recombinación homóloga de construcciones interruptoras en el genoma de gametos
c) el ARN de interferencia permite la destrucción del ARNm contra el que está dirigido
2) para que realiza la electroforesis en gel de agarosa?
3) cuantas bandas espera ver en la calle que siembra el plásmido extraído de las colonias blancas utilizado en el TP digerido con EcoRI? Justifique
1) (era media confusa y como mal redactada pero era algo asi) Para la obtencion de ratones nockout hay q realizar los siguientes pasos: a) obtención de células ES nockout embrionarias b) selección de las células recombinadas buscadas (o algo asi) c) inserción de las células en un embrión normal
En cual de los 3 pasos anteriores ocurre una recombinación homologa y/o no homologa? Justificar detallando los pasos de como sucede (o algo asi)
2)Enumerar los pasos mediante los cuales usted se cerciora que el fragmento de ADN que usted buscaba se multiplico (o algo asi, lo q había q hacer era decir todos los pasos de la guía, pero resumidos, o sea no explicar q se agrega etanol, buffer, blablabla, simplemente "se aislo el ADN plasmidico, etc")
3)Después de agregar las enzimas de restricción cuantas bandas puede ver en el gel? justifique brevemente
TP 9 CONTROL TRANSCRIPCIONAL DE LA EXPRESION GENICA
1) con respecto a los factores de transcripción que funcionan como activadores responda: cuantos dominios funcionales presentan y por que? Cual es su función en el proceso de transcripción?
2) que es un amplificador?
1) que dominios tiene un represor y cual es su funcion
2)diferencias quimicas y funcionales entre los distintas arnPolimerasas
1) ¿Que es un amplificador?
2) ¿Cuales son los dominios funcionales de las proteinas heterodimericas con funcion activadora? ¿Cual es la ventaja de la presencia de estos dominios en la transcripcion del ADN?
TP 10 SEÑALIZACION EN LA SUPERFICIE CELULAR
1) durante la experiencia práctica se utilizarán células renales caninas Madin-Darby, indique si estos cultivos corresponden a una línea celular o a un cultivo primario. Justifique
2)a- defina los siguientes conceptos: célula señalizadora, señalización autócrina, primer mensajero
b- que es la transducción de una señal?
3) Describa la vía de transducción que es activada por el ligando TNFa-1
1) con qué método usaría para la cuantificacion de proteínas. definalo brevemente.
2) Definir: a) celula señalizadora b)segundo mensajero, y c) señalizacion paracrina.
3) Con que método se cuantifican los ligandos de alta afinidad? RTA: era el de "ensayos de fijación"
1) Objetivo del TP. Condiciones de cultivo.
2) ¿De que forma una celula elimina la señal iniciada por una hormona especifica?
3) Explicar el mecanismo intranuclear de la MAP cinasa.
TP 11 MOVIMIENTO DE PROTEINAS HACIA LAS MEMBRANAS Y ORGANELAS
1) que características en la secuencia aminoacídica direccionan a una proteína integral de membrana hacia el RE. Justifique. (puede ser cualquier tipo de proteína integral?)
2) esquematice el camino de síntesis de la catalasa desde que finaliza la síntesis del ARNm correspondiente
3) que muestras se sembraran en el gel durante el TP? Que se detectará en la membrana luego de la transferencia?
1) describir los procesos por los cuales el translocon se abre y se cierra.
2) la primera parte no me la acuerdo bien...pero era algo de esquematizar el camino de sintensis de la proteina antes de llegar al sitio de krebs o una cosa asi. Y en la misma pregunta te decia que des 3 requerimientos para la entrada de la proteina a ese compartiemiento, es decir a la mitocondria...
3) ¿para que se realiza la transferencia?
esquematizar la sintesis de la catalasa desde la sintesis de su ARNm
q caracteristicas tiene la secuencia de aa de señalizacion de una proteina de membrana (o algo asi) justifique
q muestras se siembran en el gel para el inmunoblot y q se espera ver en el gel
TP 12 TRANSITO VESICULAR, SECRECIÓN Y ENDOCITOSIS
1)donde, como y para que se sintetizan los polisacaridos q se agregan alas proteinas(algo asi)
2) V o F justificar
a)Las enzimas q van ala membrana del peroxisoma utilizan la vía secretoria
b) la partícula de reconocimiento de señal es una proteína integral de la membrana del RER
3)Esquematizar el protocolo del tp
1- describir el preparado de los paramecios y las levaduras (no lo pedia asi, pero era eso)
2- v o f, justificar
a)la enzima limitante de la sintesis del colesterol no se inhibe por agregado de ldl en celulas fh (o algo asi, no me acuerdo muy bien)
b)la transcitosis es un proceso q permite clasificar proteinmas lisosomicas
3-no me acuerdo bien como era, pero pedia algo del mecanismo de la COP II
1) Tipo de vesiculas de transporte. En que vias participa cada una.
2)Indique V o F. Justifique
a)El receptor de LDL es una proteina transmembrana del Golgi para las particulas LDL que permite su transporte hacia los endosomas tardios.
b)La via secretoria puede estudiarse mediante el uso de la GFP.
3)Describa el preparado de PMN. ¿En que se basa la funcion de estos globulos blancos?
1) cuales son las diferencias entre secrecion constitutiva y regulada
2) cuales de las siguientes afirmaciones es incorrecta justificar:
a)la sintesis de enzimas lisozomicas empieza en ribosomas libres
b) una señal en el n-terminal de la cadena peptidica lo lleva al RE
c) una segunda señal hidrofoba lo dirige al lizosoma
3)(no me la acuerdo bien xo era algo asi) q tipo de celulas se ven en el practico q fagocitan?? q fagocitan? con que objetivo
1) describa el mecanismo de ensamblaje en las cubiertas COP II
2) diga si los siguientes enunciados son verdaderos o falsos. Justifique en no mas de 3 renglones
a) en la hipercolesterolemia familiar, la enzima limitante de la vía de síntesis del colesterol no se inhibe a pesar del aumento de LDL
b) la transcitocis es un mecanismo que sirve para clasificar las enzimas lisosomales
3) describa el preparado que realizará durante el tp utilizando paramecios
TP 13 CITOESQUELETO
1)como era el experimento de decoracion de
micro filamentos con miosina?(algo asi)
2) en que situacion se puede desamblar los filamentos intermedios??? con que mecanismo y con que fin?
3) se sumerje un filamento de actina, en una solucion dnd la concentracion de actina g es superior a la cc+ xo inferior ala cc-, q sucedera con los extremos?
1) ¿Por que los ratones que expresan una queratina mutante presentan anomalias cutaneas?
2) Se sumerje un filamento de actina F en una solucion donde la concentracion de actina G es superior a la Cc- ¿Que sucedera con los extremos?
3) Mencione los pasos de la locomocion celular del queratinocito.
TP 14 CICLO CELULAR (faltan)
EL ALTILLO
1) Para que se usa el FADH? que función cumpliría al agregar este compuesto en el experimento?
2) Para que sirve la vaselina liquida?
3) Qué función cumple el succinato de sodio 5%?
Sobre Fracción microsomal...
4) Qué reactivos se usan para ensayar la reacción?
1) ¿Cuál es el fundamento de la técnica descripta en la guía de TP para caracterizar funcionalmente al RE o a una fracción microsomal?
2) Indique cuál/es enunciado/s es/son correctos. Justifique su respuesta
a.) La fracción nuclear se caracterizará mediante una reacción enzimática que utiliza azul de metileno como indicador redox.
b.) La centrifugación en gradiente de sacarosa permite purificar organelas a partir de una fracción impura.
c.) Según el esquema clásico de fragmentamiento mediante centrifugación diferencial, los peroxisomas, los lisosomas y el RE se obtienen en la fracción microsomal.
3) ¿Cuál de los siguientes microscopios se debe usar para visualizar estructuras subcelulares en células vivas? Justifique su respuesta.
a.) MET
b.) MEB
c.) MO campo claro
d.) Microscopio óptico de campo diferencial
En un laboratorio se desea purificar una proteína de la membrana mitocondrial interna, para lo cual se decide en primer lugar, realizar una centrifugación diferencial según el esquema clásico. Justifique todas sus respuestas
A) ¿de cual de los siguientes materiales podría partir? seleccione la/s mas adecuada/s: hígado, glóbulos rojos, páncreas y linfocitos
B) en que fracción subcelular encontrara la proteína buscada?
C) Que reacción enzimática podría utilizar para caracterizar la fracción subcelular aislada?
D) en dicha fracción: ¿existe algún otro compartimiento subcelular además de las mitocondrias? si su respuesta es afirmativa ¿que metodología usaría para obtener mitocondrias puras?
E) como podría confirmar que luego de este ultimo procedimiento obtuvo solo mitocondrias libres de de otras organelas?
2) cualquiera de las siguientes afirmaciones describe características propias de las biomembranas excepto: justifique
A) las biomembranas presentes en una célula pueden tener una relación lípido/proteína diferente
B) las dos hojas de una biomembrana puede contener diferentes proteínas y fosfolípidos.
C) algunas biomembranas tienen extremos libres
D) en la mayoría de las biomembranas la sprimetinas transmembranas se re-orientan espontáneamente.